自从鸣人和大和队长等改革派见证了佐助的实力和政治觉悟性之后，鸣人的政治觉悟性也随之觉醒，特别是自来也死于革命党主席漩涡长门之手，直接导致改革派和革命派之间的彻底对立。说到漩涡长门，他早期深受改革派领袖自来也的思想影响，后来在回国参加革命行动的时候被政治斗争的尔虞我诈刺激成了偏执狂，并且被革命党里的野心家宇智波斑利用，最后策动了改变木叶民主进程的木叶大毁灭事件。具体过程是这样的：鸣人在感愤于自来也老师之死后，化悲愤为力量，到妙木山党校学习，妙木山党校校长大蛤蟆仙人告诉鸣人，一切政治都是要靠实力的，枪杆子里出政权是放之四海而皆准的道理，当然吸收一切力量为我所用同样重要，其中舆论的力量最为重要。还有一种力量同样十分重要，那就是超自然力量，它融合了军事和思想两方面的力量。我们妙木山党校之所以成为国家指定党员培训中心，就是因为我们可以教你们熟练运用这种力量，在忍术上击垮敌人，并且利用超自然的力量使群众顶礼膜拜。在鸣人刚刚毕业之后，他的同宗并且同师的师兄漩涡长门在没有宣战的情况下突然闪击木叶，而木叶在强烈谴责和严重关切之后马上发动反击，可惜在长门的先进武器和超常规战术之下迅速溃败，最后长门在向五代火影纲手勒索未果的情况下，使用大规模杀伤性武器，导致木叶死伤无数，一片狼藉，就在此时，鸣人出现的惊人的巧合，并不可思议的力败长门，以至于守旧派中有人指出鸣人可能跟国外敌对势力或者国内反动势力勾结合演的一场戏，不过对于这些不和谐的声音，受到鸣人莫大恩惠的百姓只当做是对英雄的诋毁而大加谴责，这时，民众们就像突然觉醒，再也不是浑浑噩噩的度日，转而支持鸣人代表的改革派的政治主张。不过守旧派的看法并非全错，长门在最后关头的确故意放水，并反过来帮助鸣人拯救木叶死去的村民，将鸣人的声望推到了新的高度。在政治家看来，一切的巧合都是阴谋。而老百姓只以结果或者效果来判定一件事的对错，所以他们往往成为被利用的工具。
木叶崩溃事件之后，一直呆在暗处伺机而动的团藏终于抓住纲手因为拯救木叶而重伤昏迷的机会，挟持火之国高层承认他为第六代火影，实现他半个世纪的梦想。
然而国际恐怖组织——晓组织到处捕捉尾兽开发核武器的事情随着雷之国雷影的弟弟八尾奇拉比的被捉而曝光，特别是完成捕捉任务的是木叶各个派系都十分关注的佐助。雷影闻讯后暴跳如雷决定召开五大国第一次全体代表大会，商讨救回人质，严惩凶手的方案。地点就在铁之国。
此时，佐助与哥哥宇智波鼬的战斗已经结束，并从斑的口中得知整件事情的经过，在感叹哥哥的伟大的同时，他也深深感到木叶高层的卑劣，他决定支持宇智波斑的革命理论，但仅仅限于打击木叶高层，进行斩首行动，第一目标就是团藏。
在此期间木叶正忙于重建，在重建过程中发现木叶很多建筑都属于豆腐渣工程，经过彻查，发现所有问题矛头都指向木叶高层顾问转寝小春的儿子，于是全国上下义愤填膺，掀起一股反腐倡廉的整治运动。另外有人举报一乐拉面店的老板使用地沟油和超标防腐剂，但是随即被人压下，有关人士指出，一乐拉面店的后台十分强硬，老板的女人是政府一位高官的情妇，同时鉴于国家未来领导人对拉面产生了斯德哥尔摩综合症，政府只是对其做了勒令停业整顿的处理，但是却牵扯出一个庞大的地沟油生产利益链，并导致很多政府官员落马，这也成功的转移的公众的视线。
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